При хирургических вмешательствах хорошо зарекомендовали себя инъекции кетамина HCl и ксилацина. Шприц наполняют кетамином HCl (100мг/1кг веса тела) и ксилацином (5 мг/1 кг веса тела), после чего делается внутримышечная инъекция. Приблизительно через 5 минут животное оказывается лежащим на боку, а через 10 минут можно начинать операцию. Продолжительность действия лекарств - 60 минут, а сна после операции - 4 часа. При этом виде наркоза не нужна ваголитическая премедикация атропином. 

Ингаляционный наркоз с использованием капель галотана менее популярен. Применяя его, нужно следить, чтобы пропитанная лекарством ткань не касалась слизистой оболочки носа, так как могут возникнуть реакции на коже. Он также предполагает обязательную подкожную премедикацию атропином (0,10 мг/1 кг веса тела), чтобы избежать сильной секреции слюны, которую животное может вдохнуть. Перед наркозом животных не следует кормить 12 часов. Если в качестве подстилки используется сено, то необходимо убрать и подстилку. 

В течение нескольких дней перед анестезией морской свинке необходимо давать вместе с водой витамин С (1-2 мг/1 мл), так как недостаток витамина С может повлиять на глубину наркоза и продолжительность сна животного. Во время пробуждения от наркоза морские свинки становятся очень чувствительными к понижению температуры. После хирургического вмешательства их необходимо поместить под инфракрасную лампу или положить на грелку, причем температура тела пациента (39°С) должна поддерживаться на постоянном уровне до полного пробуждения.